真菌又称霉菌，可引起多种疾病。在人体的泌尿系统中普遍存在多种酵母菌，但绝大多数是不致病的。真菌性前列腺炎是由于真菌感染引起的前列腺的炎症反应，真菌感染前列腺常常发生在全身与局部免疫力功能明显低下或长期大量应用广谱抗生素所致。
前列腺真菌感染常为全身性感染的一部分，所以治疗应该包括全身及局部治疗。多种抗真菌性药物可以选择应用，全身应用广谱抗真菌药物可以选择两性霉素B、氟康唑、酮康唑或咪康唑等，连续治疗一个月以上，一般需要治疗2~3个月，应该注意抗真菌药物的副作用。应用小苏打等药物碱化尿液，不利于真菌的生长，也有一定的治疗作用。皮下注射使用含有白色念珠菌孢子体的特制菌苗，可以特异性的增强机体对该病原体的免疫排斥作用。鸟岛内灌注龙胆紫可以直接杀灭局部的病原体。
在治疗真菌性前列腺炎时，一定要对患者的配偶进行检查，因为很多男性获得真菌感染的重要途径之一就是通过夫妻性生活。妻子可能是感染的来源，或者成为受害者被动感染的，但却特别容易成为长期慢性带菌者而不断地感染丈夫，遭致治疗的失败。
在生活中也要注意卫生，尤其是局部的卫生，定期更换内裤。对内衣、内裤、床单、枕巾、洗浴用具等进行开水洗烫消毒，彻底清除传染源。对同时合并的真菌性龟头炎也必须给予相应的治疗。
