尖锐湿疣的亚临床表现是指肉眼看不到疣体，经3%～5%醋酸涂布或湿敷后，醋酸白试验阳性，以后研究发现该区域经免疫组化和病理活检证实有人乳头瘤病毒(HPV)感染。该类病人临床上无症状，可成为带病毒者，通过性接触而感染他人。男性的亚临床感染容易发生于阴茎与阴囊，女性常为多灶性，常可发生于尿道口，阴唇及前庭。此外，还有存在更早期的入乳头瘤病毒感染，该期无细胞学和组织学上的改变，只能通过人乳头瘤病毒DNA检测才能鉴定，称为人乳头瘤病毒的潜伏期。