男性尖锐湿疣好发于冠状沟、龟头、包皮、系带、尿道口,少数见于体部。0.5%-5%地男性生殖器疣可由尿道口蔓延至尿道黏膜。男性同性恋者多见肛周及肛内湿疣,可蔓延到直肠黏膜,这些部位地湿度为HPV感染提供了更为适宜地环境。肛门及直肠内湿疣可有疼痛和里急后重感。

女性湿疣好发于大阴唇、小阴唇、阴蒂,亦可见于会阴,约1/3伴有阴道湿疣,6%-20%伴有子宫颈湿疣。阴道和宫颈湿疣早期无明显症状,晚期可出现白带增多和性交后出血。女性外阴部湿疣因为阴道分泌物地刺激,损害常较男性者大。待别是孕妇地尖锐湿疣,疣体更明显增大,可能和激素代谢地改变有关。

偶见于腋窝、脐窝、乳房等处,尤其易发生于有慢性淋病、白带多及包皮过长者。除以上部位外,人体地其他部位如口腔、足趾间等亦可患病。